MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013715	TTC	2	6	1944	1949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013715	AAGG	2	8	1989	1996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013715	TAC	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013715	A	6	6	2045	2050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013715	TCC	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013715	ACCG	2	8	2079	2086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013715	GAA	3	9	2193	2201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013715	GGAT	2	8	2370	2377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013715	CG	5	10	2381	2390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013715	CG	3	6	5060	5065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013715	TGA	2	6	5094	5099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013715	GGC	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013715	CAT	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013715	GA	3	6	5297	5302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013715	GGC	2	6	5326	5331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013715	CA	3	6	5432	5437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013715	CCCG	2	8	5438	5445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_013715	TTG	2	6	5465	5470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013715	GAC	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013715	CCG	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013715	GCG	2	6	5642	5647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013715	CT	3	6	5902	5907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013715	TAAAA	2	10	5915	5924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013715	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013715	TG	3	6	11444	11449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013715	TGG	2	6	11466	11471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013715	GCC	2	6	11479	11484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013715	GAA	2	6	11604	11609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013715	AGG	2	6	11620	11625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013715	AAT	2	6	11716	11721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013715	GAA	2	6	11722	11727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013715	ATT	2	6	11728	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013715	GT	3	6	11752	11757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013715	TGTGGG	2	12	12003	12014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013715	T	6	6	12072	12077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013715	GTT	2	6	12093	12098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013715	CTG	2	6	12103	12108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013715	TGC	2	6	12153	12158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013715	TTC	2	6	12182	12187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013715	AAT	2	6	12315	12320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013715	GT	3	6	12325	12330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013715	AAAG	2	8	12336	12343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013715	AC	3	6	12376	12381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013715	T	6	6	12472	12477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013715	ATG	2	6	14185	14190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013715	AGG	2	6	14201	14206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013715	CTG	2	6	14671	14676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013715	CTAA	2	8	16087	16094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013715	A	7	7	16093	16099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013715	TAG	2	6	16142	16147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013715	CTC	3	9	16462	16470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013715	C	6	6	16481	16486	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_013715	A	6	6	16488	16493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013715	A	6	6	16505	16510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013715	GCC	2	6	16521	16526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013715	GCGG	2	8	16545	16552	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013715	TC	3	6	16556	16561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013715	CGC	2	6	16578	16583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013715	GCG	2	6	16586	16591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013715	AGA	2	6	16621	16626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013715	GCCC	2	8	17077	17084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_013715	A	6	6	17103	17108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013715	CTG	2	6	17713	17718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013715	TTC	2	6	17761	17766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013715	GCG	2	6	18846	18851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013715	GC	3	6	18944	18949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013715	CCG	2	6	19579	19584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013715	CAG	2	6	19602	19607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013715	AAC	2	6	19687	19692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013715	GT	4	8	19774	19781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013715	A	6	6	19788	19793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013715	CAA	2	6	19810	19815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013715	GAA	2	6	19826	19831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013715	GAA	2	6	19875	19880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013715	CAGGGG	2	12	21139	21150	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013715	CGC	2	6	21177	21182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013715	GCA	2	6	21198	21203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013715	GCCCC	2	10	21243	21252	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
79	NC_013715	ATG	2	6	21309	21314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013715	GAGTAA	2	12	21357	21368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013715	AAG	2	6	21369	21374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013715	GAGT	2	8	21421	21428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013715	TGAA	2	8	21432	21439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013715	ATT	2	6	21466	21471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013715	GA	4	8	21473	21480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013715	GAG	2	6	21533	21538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013715	AGG	2	6	21561	21566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013715	CCT	2	6	21745	21750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013715	GGGC	2	8	21801	21808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013715	TGG	2	6	21831	21836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013715	CGTC	2	8	21938	21945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013715	ACC	2	6	21978	21983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013715	A	6	6	22019	22024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013715	GGA	2	6	22061	22066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013715	A	6	6	22121	22126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013715	CCG	2	6	22142	22147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013715	ACA	2	6	23614	23619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013715	GCC	2	6	23707	23712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013715	AGC	2	6	23741	23746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013715	ACGC	2	8	23755	23762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013715	ACAT	2	8	23798	23805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013715	TAA	2	6	23809	23814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013715	AAG	2	6	23820	23825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013715	CAAA	2	8	24492	24499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013715	TCAC	2	8	24545	24552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013715	CCA	2	6	24589	24594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013715	CA	4	8	24607	24614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013715	GCC	2	6	24624	24629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013715	AT	3	6	25707	25712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013715	CTG	2	6	25742	25747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013715	ACA	2	6	25810	25815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013715	GTAGA	2	10	25870	25879	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013715	CG	3	6	25904	25909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013715	AAC	2	6	25915	25920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013715	ACGT	2	8	27821	27828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013715	CT	3	6	27832	27837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013715	TCAA	2	8	28876	28883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013715	TCG	2	6	28887	28892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013715	GCGA	2	8	28910	28917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013715	GGGGAG	2	12	29529	29540	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013715	GT	3	6	33284	33289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013715	GAG	2	6	33301	33306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013715	GTT	2	6	33332	33337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013715	T	6	6	33353	33358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013715	T	6	6	33390	33395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013715	TATT	2	8	33433	33440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013715	A	6	6	33451	33456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013715	TTG	2	6	33537	33542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013715	A	6	6	33622	33627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013715	TAA	2	6	33656	33661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013715	A	6	6	33660	33665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013715	CGC	2	6	33712	33717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013715	CG	3	6	33756	33761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013715	TA	4	8	33801	33808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013715	TA	3	6	33952	33957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013715	CGT	2	6	34905	34910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013715	CCT	2	6	34911	34916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013715	AGAA	2	8	35982	35989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013715	TGT	2	6	37744	37749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013715	GCG	2	6	37769	37774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013715	TTG	2	6	37821	37826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013715	CGGGG	2	10	38696	38705	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013715	T	6	6	38708	38713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013715	ACC	2	6	38763	38768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_013715	TCAC	2	8	38800	38807	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013715	TGG	2	6	42636	42641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013715	GT	3	6	42650	42655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013715	TGG	2	6	42720	42725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013715	GCG	2	6	42736	42741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013715	CAC	2	6	42768	42773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_013715	AT	3	6	42776	42781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013715	AT	3	6	42794	42799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013715	ACTC	2	8	42818	42825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_013715	TGAT	2	8	43524	43531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_013715	TGG	2	6	43722	43727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013715	TGC	2	6	43873	43878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_013715	CTTG	2	8	48045	48052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_013715	TG	3	6	50251	50256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_013715	AT	3	6	85316	85321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_013715	TGT	2	6	85330	85335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_013715	TGA	2	6	126681	126686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_013715	AGC	2	6	137324	137329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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